醫院各部門的功能、設施和人員組成情況不同，產生污水的主要部門和設施有：診療室、化驗室、病房、洗衣房、X光照洗印、動物房、同位素治療診斷、手術室等排水；醫院行政管理和醫務人員排放的生活污水、食堂、單身房、家屬宿舍排水。不同部門科室產生的污水成分和水量各不相同，如重金屬廢水、含油廢水、洗印廢水、放射性廢水等。而不同性質醫院產生的污水也有很大不同。醫院污水來源成分復雜，含有病原性微生物、有毒、有害的物理化學污染物和放射性污染物等，具有空間污染、急性污染和潛伏污染等特征，不經有效處理會成為一條疫病擴散的重要途徑和嚴重污染源環境，所以小型衛生院污水處理設備的需求越來越緊急。